Одним из главных направлений своей деятельности руководство театра «Санктъ-Петербургъ Опера» считает гастроли в российских регионах. Коллектив показывал свои спектакли не только в Москве, Костроме, Ярославле, Пскове, Костомукше, Великом Новгороде, Петрозаводске, Калининграде, но и в таких отдаленных районах, как Салехард Ямало-Ненецкий автономный округ) и Якутск (республика Саха).
Театр принимает активное участие в российских фестивалях («Звезды белых ночей» в Санкт-Петербурге, «Дни Петербурга в Якутии», «Панорама музыкальных театров России» в Свердловске и т.д.), демонстрируя все грани современного оперного искусства, как в классическом жанре, так и в сфере эксперимента.
В феврале 2010 года в театре «Санктъ-Петербургъ Опера», Мариинском театре, Театре Музыкальной комедии и на других крупных сценических площадках города прошел фестиваль, посвященный 35-летию творческой деятельности художественного руководителя театра — Юрия Александрова.
Заграничные гастроли театра «Санктъ-Петербургъ Опера» имеют широкую географию. Он был одним из первых российских театральных коллективов, посетивших с гастрольным туром США сразу после трагических событий 11 сентября 2001. Гастроли прошли с аншлагами и получили высокую оценку в американской прессе.
С большим успехом прошли гастроли «Санктъ-Петербургъ Оперы» в Финляндии, где театр принял участие в фестивале русской музыки. В Швейцарии он участвовал в музыкальном фестивале Musiksommer. В 2008 году состоялись гастроли в Польше и Швеции. В рамках XII-го Быдгощского оперного фестиваля, была представлена «Пиковая дама» П.И. Чайковского на сцене театра «Opera Nova». В Швеции коллектив театра участвовал в известном фестивале «Далхалла» со спектаклем «Чио-Чио-сан» Дж. Пуччини.
Гастроли в США, Германии, Швейцарии, Польше, Литве, Швеции укрепили мировую репутацию «Санктъ-Петербургъ Оперы» как высокопрофессионального творческого коллектива, владеющего многообразными театральными стилями, ориентированного на обновление средств выразительности оперного жанра. Театр также осуществляет творческие обмены. В 2006 году состоялись обменные гастроли солистов театра «Санктъ-Петербургъ Опера» и белградской труппы «Мадленианум», возобновление которых планируется в 2011 году.

